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在農藥登記領域，QSAR主要用于原藥等同性評估（Technical Equivalence），也即TE評估。TE評估主要是確定不同來源的原藥在化學組成上的相似性。TE評估有兩個重點：首先要滿足如果新來源活性成分含量要不低于參考來源（既要保證農藥的效果），接下來在滿足上述條件的基礎上，要保證雜質的毒性不高于參考來源。如果新來源的原藥與參照原藥的危害性等同或更安全，則可以認為新來源的原藥與參照原藥等同。→點擊咨詢農藥登記

TE評估通常分階段進行，第一階段為產品化學資料認定，主要包括原藥的生產工藝、產品化學、原藥以及雜質的質量分析。若出現新的雜質或雜質含量增加等情況，則第一階段認定不等同，需要進入第二階段，即毒理與生態環境資料認定。→點擊咨詢農藥登記

農藥原藥在生產過程中會出現雜質，若根據雜質的含量和類型等無法判定是否為毒理學相關雜質時，需要進行毒理學資料和環境毒理資料的認定。雜質往往都是新物質，毒理相關數據較少，無法確定毒性風險。另外，這些雜質還往往含量較低且不易于獲取，從而難以開展測試。在農藥雜質的毒理認定中，歐盟、墨西哥、巴西等很多國家和地區都建議采用QSAR預測的方式獲取數據進行雜質毒性評估。→點擊咨詢農藥登記